Les dangers sont nombreux en l'an 2099, mais aucun ne l'est plus que les corporations corrompues qui dominent le monde. Miguel O'Hara, en tentant d'échapper à son employeur Alchemax, acquiert d'incroyables pouvoirs et devient le Spider-Man d'une nouvelle ère ! À nouveaux héros, nouveaux ennemis ! Le Vautour, Thanatos et d'autres sont de la partie. Et comment réagira Miguel quand le Docteur Fatalis tentera de conquérir le monde ?