Marseille, 18ème siècle. Alors que les échevins persistent à ne voir qu'une maladie de pauvres dans la contagion provoquée par la cargaison d'étoffes du "Grand Saint-Antoine", l'épidémie de peste prend des proportions effrayante. Bloqué dans la ville de Marseille, le jeune chirurgien Mathieu Gensoul tente d'échapper à ceux qui cherchent à le réduire au silence en faisant de lui le bouc émissaire idéal, responsable de l'introduction de la peste. Si la maladie l'épargne, parviendra-t-il à échapper aux galères ?